2006年8月2日 民進(jìn)黨“立委”謝欣霓向“高檢署查黑中心”告發(fā)，指馬英九挪用特別費(fèi)當(dāng)生活費(fèi)，存款暴增。查黑中心4日簽分“查字第18號(hào)”案，交由檢察官侯寬仁調(diào)查。

　　2006年9月起 檢察官展開調(diào)查后，共傳訊證人上百人，同時(shí)逐一清查1萬(wàn)多張發(fā)票單據(jù)。

　　2006年11月14日 馬英九以關(guān)系人身分到案說明。

　　2006年11月15日 約談市長(zhǎng)秘書余文及10名相關(guān)證人，厘清化零為整的報(bào)帳方式是否涉及偽造文書，包含余文在內(nèi)的11位關(guān)系人訊后均飭回。余文則被改列貪瀆、偽造文書案的犯罪嫌疑人，并限制出境。

　　2006年11月17日 馬英九首度表示，若此案遭起訴，就會(huì)依照黨章規(guī)定停止黨權(quán)。

　　2006年11月17日和22日 馬英九先后捐款逾1500萬(wàn)元。

　　2006年11月20日 馬英九晚間在黨中央和“立委”一起吃便當(dāng)再度強(qiáng)調(diào)，特別費(fèi)案他絕對(duì)經(jīng)得起考驗(yàn)，如果連他都有問題，那么民進(jìn)黨“四大天王”一個(gè)都跑不掉。

　　2006年11月23日 馬英九二度遭“查黑中心”約談，面對(duì)媒體詢問約談狀況，馬英九說不方便透露內(nèi)容，但他比出手勢(shì)說了聲“Safe”，似乎對(duì)自己很有信心。

　　2006年11月24日，國(guó)民黨主席、臺(tái)北市長(zhǎng)馬英九表示，如果他被訴，會(huì)立即辭去黨主席職務(wù)。

　　2006年11月30日 臺(tái)北市政府上午由委任會(huì)計(jì)師周志誠(chéng)說明市長(zhǎng)馬英九的捐款細(xì)目。周志誠(chéng)指出，馬的捐款共236筆，總金額為6809萬(wàn)4910元；其中捐給團(tuán)體的有188筆，捐給個(gè)人有48筆；就項(xiàng)目觀察，捐給公益團(tuán)體占87.54%，捐給慈善團(tuán)體占3.28%，其余10%為教育、學(xué)術(shù)團(tuán)體，馬英九的捐款數(shù)，遠(yuǎn)超過他支領(lǐng)的市長(zhǎng)特別費(fèi)。

　　2006年1月26日 馬英九表示，他完全依照“行政院”規(guī)定使用特別費(fèi)，希望司法能盡快還他清白，面對(duì)國(guó)民黨內(nèi)質(zhì)疑他上了別人的當(dāng)，他表示若遭起訴就會(huì)下臺(tái)以示負(fù)責(zé)，因?yàn)榧o(jì)律很重要。

　　2006年2月7日 侯寬仁檢察官三度訊問馬英九談特別費(fèi)屬性，最后認(rèn)定特別費(fèi)必須用在公務(wù)，但馬英九把8年市長(zhǎng)任內(nèi)1632萬(wàn)不需單據(jù)的特別費(fèi)全部匯進(jìn)個(gè)人戶頭，甚至還申報(bào)個(gè)人財(cái)產(chǎn)。

　　2007年2月9日 馬英九接受東森新聞專訪，表示，“我講究清廉，不貪財(cái)、不收禮，我沒有犯罪的意圖、也沒有罪的事實(shí)，為什么被認(rèn)為犯罪”，如果因此被起訴，“我很難接受”。

　　2007年2月13日 “高檢署查黑中心”下午宣布，以貪污罪嫌起訴馬英九，涉嫌“詐領(lǐng)”1117萬(wàn)元。

　　資料來源：綜合臺(tái)灣東森新聞和中時(shí)電子報(bào)