中新網(wǎng)6月6日電 美國(guó)SGI公司5日在北京宣布為國(guó)內(nèi)兩家主要SARS病毒研究機(jī)構(gòu):中科院基因組生物信息學(xué)中心(北京華大基因研究中心)和上海藥物研究所提供最新的SGI Origin系列超級(jí)計(jì)算機(jī)以及相關(guān)可視化系統(tǒng),以期利用SGI在超級(jí)計(jì)算和分子結(jié)構(gòu)模擬與顯示領(lǐng)域的獨(dú)特技術(shù),加速國(guó)內(nèi)對(duì)SARS病毒染色體的研究和相應(yīng)疫苗及特效藥的開(kāi)發(fā)。
據(jù)介紹此前,上海藥物研究所已經(jīng)成功構(gòu)造了一定數(shù)量的SARS病毒蛋白質(zhì)的3D模型,并利用潛在藥物化合物數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)病毒蛋白質(zhì)進(jìn)行了虛擬顯示。
SGI向上海藥物研究所提供了一臺(tái)配置64個(gè)處理器的SGI Origin 3800超級(jí)計(jì)算機(jī)、一臺(tái)配置4個(gè)處理器的SGI Origin 3200系統(tǒng)和15臺(tái)SGI圖形工作站。這些設(shè)備可以模擬和顯示數(shù)以百萬(wàn)計(jì)的分子結(jié)構(gòu),并從中開(kāi)發(fā)可抗擊SARS病毒的化合物。上海藥物研究所SARS研究組組長(zhǎng)蔣華良博士解釋說(shuō):“我們提供化學(xué)和藥理學(xué)領(lǐng)域的海量虛擬顯示,希望在接下來(lái)的三個(gè)月里可以找到一種能夠抗擊SARS病毒的高效化合物!
中科院基因組生物信息學(xué)中心是國(guó)際染色體工程協(xié)會(huì)成員,是亞洲太平洋地區(qū)最大的非贏利性的染色體研究機(jī)構(gòu),也是世界三大染色體研究中心之一,該研究所采用了兩臺(tái)SGI 32處理器的Origin3000超級(jí)計(jì)算機(jī),一臺(tái)5TB TP9100存儲(chǔ)系統(tǒng)以及若干SGI可視化系統(tǒng)。這些技術(shù)主要應(yīng)用于SARS病毒主要染色體和相關(guān)蛋白質(zhì)排序模型創(chuàng)建和虛擬顯示,以及多種計(jì)算應(yīng)用。
SGI公司CEO兼董事長(zhǎng)BOB Bishop先生表示,SGI將竭盡所能為這些研究機(jī)構(gòu)所從事的重要工作提供服務(wù)。SGI充分了解中國(guó)SARS病毒研究的急迫性,SARS便毒研究走向成功需要先進(jìn)的技術(shù)支持,并將在高性能計(jì)算和虛擬顯示領(lǐng)域的特長(zhǎng)一定能加快病毒研究的步伐。”
SGI公司還宣布,日本Kitasato大學(xué)和SGI日本公司正在合作,進(jìn)行SARS病毒蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)研究,這將在世界范圍內(nèi)加速SARS疫苗的開(kāi)發(fā)與研究。