當(dāng)你坐在家里玩著《模擬人生》、《模擬城市》等游戲時是否知道,世界各地有一批科學(xué)家,也坐在他們的實驗室里,在計算機上模擬著H1N1甲型流感病毒的傳播?
他們的模擬是基于數(shù)學(xué)模型和流行病學(xué)的基礎(chǔ)。在疾病變化迅速的今天,研究流行病學(xué)的人并不一定要穿著白大褂,躲在臨床試驗背后,也不一定要往返著調(diào)查患者,長年地跟蹤疾病的變化,今天,坐在計算機前面,也可以對疾病的擴散趨勢胸有成竹。
依據(jù) 根據(jù)交通建模型
今年三四月份,H1N1甲型流感在墨西哥爆發(fā),隨后,病毒在北美爆發(fā),很快,全球各地都出現(xiàn)了病例,中國采取了嚴(yán)格的防控隔離措施,但病例也接二連三地出現(xiàn)。
而這一情形,在還沒發(fā)生之前,就已經(jīng)出現(xiàn)在美國印第安納大學(xué)信息學(xué)院的 “全球流行疾病傳播模式”項目實驗室里了。實驗實所用的模型結(jié)合了人口統(tǒng)計學(xué)和人口移動數(shù)據(jù),用空間結(jié)構(gòu)隨機模型的方式來模擬全球范圍內(nèi),流行疾病的擴散趨勢。在此前,很少有電腦參與到流行病學(xué)的理論推測中。
據(jù)參加電腦模擬病毒傳播項目的中國留學(xué)博士胡浩介紹,在SARS之后,這個模式曾經(jīng)對個別城市進(jìn)行模擬,此后又對人傳人的禽流感進(jìn)行模擬,從05、06年開始,這個模式中開始鋪上全球的地圖,并在今年開始進(jìn)行H1N1病毒傳播趨勢的預(yù)測。
患者可以通過坐飛機很快地將病毒帶到另一個城市或國家。因此,當(dāng)已知流感爆發(fā)的第一個國家是墨西哥之后,要預(yù)測病毒在其他國家的傳播,最重要的數(shù)據(jù)便是交通數(shù)據(jù)。
“我們借助航班和城際交通數(shù)據(jù),制作交通網(wǎng)絡(luò),看在全世界范圍內(nèi)人們怎么移動,怎么分布,然后再依據(jù)其建立模型。”胡浩說。
調(diào)整 幾個參數(shù)很重要
人口的城際交通移動分為兩層,城市與城市之間短程的移動,通常通過飛機或火車實現(xiàn),兩個國家之間的移動則主要是航班,研究人員將全球的航空數(shù)據(jù)加上大約30個國家的每日的城際交通數(shù)據(jù)構(gòu)建出了一個碩大的交通網(wǎng)。
“我們將全球劃分成很多既小又精確的格子,稱為人口網(wǎng)格,每個格子統(tǒng)計有多少人口。這些個格子概括了世界各地人口的移動。”胡浩說。這個網(wǎng)格的依據(jù)就是以3300多個機場為中心,按照機場附近的人口分布來設(shè)置。最初,研究人員因為沒考慮到小城市邊上往往有很大的城市,因此產(chǎn)生了誤差,經(jīng)過調(diào)整,城市網(wǎng)絡(luò)的人口分布精確了很多。
在確立了交通的數(shù)據(jù),人口的分布之后,研究人員還需要將流行病學(xué)的模式加入進(jìn)去。流行病學(xué)有著很多模式,最經(jīng)典的模型是“S-I-R”,三個字母分別代表易感人群、傳染人群和已恢復(fù)人群即已經(jīng)從染病者中移出的人群。這是科學(xué)家1927年采用動力學(xué)方式建立的模型,成為流行病學(xué)模型中的一個經(jīng)典。
不過,這個模型中,病人的日接觸率是一個常數(shù),有效接觸率傳染力是不變的,這就導(dǎo)致結(jié)果存在一定的誤差。對于善變的流感病毒而言,模型要復(fù)雜得多,還要考慮潛伏期,人群特征等各種因素。
“做流行病學(xué)的模型,最關(guān)鍵的是要知道平均會感染多少人!焙普f。病毒的傳播能力又叫再生數(shù),這個數(shù)值在世界衛(wèi)生組織會對每個傳染病毒有個值。再生數(shù)越小的,病毒的傳播能力就越弱,比如1918年的西班牙流感,再生數(shù)大于2.5,而今年的甲型H1N1流感,再生數(shù)估計在1.4-2.5之間。
應(yīng)用 預(yù)知何時進(jìn)入中國
在經(jīng)過人口分布模型與流行學(xué)模型的融合之后,再經(jīng)過幾個小組無數(shù)次的演算,研究人員終于趕在發(fā)生之前預(yù)測出了一些較為準(zhǔn)確的結(jié)果。
比如,在5月份之前,他們便預(yù)測出甲流將在5月份進(jìn)入中國,這一情況與后來發(fā)生的事實吻合。在多數(shù)情況下,某個國家出現(xiàn)病例的時間都在預(yù)測的范圍之內(nèi)。
計算機模擬的結(jié)果能對決策起到一定作用。此前曾有個別地方產(chǎn)生恐慌,認(rèn)為只有關(guān)閉機場這樣絕對的方式才能阻止病毒,然而經(jīng)過模擬,研究人員發(fā)現(xiàn),除非在病毒級別還很低的時候就關(guān)掉邊境,或者將航班減少到十分之一,只有這樣才能有效將國家之內(nèi)的爆發(fā)壓下來,假設(shè)關(guān)得稍微晚了一點,或者關(guān)得不夠多,依舊無法起到效果。
“如果關(guān)掉一半的航班,那還會有一半的航班會代入病例,除非減少到十分之一,否則將得不償失,產(chǎn)生很大的經(jīng)濟損失!焙普f。也正因為此類的預(yù)測,最終,世界衛(wèi)生組織采取了不建議關(guān)閉機場的決定。
背景
跟蹤美元了解人口移動
具體到了一個城市里面,要模擬人群的傳播就成了另外一個問題。如果說,計算城際之間傳播的模型主要還運用在輸入性病例上,那在一個城市中,還存在本土病例的情況。在世界各地模擬單個城市中甲流病毒傳播的科研小組中,有的通過城市交通工具為主要依據(jù),有的則將視線放在更小的對象———個體的人身上,比如會將每個人作為模擬的對象,模擬其每天上學(xué)、工作、去商店等行為,并盡可能地推斷出可能傳染的人數(shù)。
現(xiàn)在除了美國印第安納大學(xué),美國西北大學(xué)也在進(jìn)行這方面的研究。
1998年,一個叫做漢克埃斯金的程序員在每張經(jīng)過自己之手的美元上都做了注釋,提醒接觸到這張鈔票的人都到一個名叫“喬治去哪兒了?”的網(wǎng)站上登記接受地的郵政編碼,這個程序員只是出于好奇的目的,卻發(fā)現(xiàn)了這張鈔票隨著形形色色的人經(jīng)過了各地的飯店、小商販、賽馬場、脫衣舞夜總會……如今,這個網(wǎng)站已經(jīng)變成一個流行的游戲網(wǎng)站,有超過300萬的人注冊了1億多美元的行蹤。
這個無心插柳的小故事啟發(fā)了美國西北大學(xué)的德布克教授,他在近幾年開展了美國國土上美元地理分布的調(diào)查,通過對價值464670美元的鈔票的行蹤的檢查,他們得出了相應(yīng)的人口移動模型,其結(jié)果精確,受到了流行病學(xué)界的肯定。
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