這一階段，水下考古隊(duì)員繼續(xù)使用雙瓶壓縮空氣，在水下工作中盡量使用全面罩和水下三方通話系統(tǒng)，保持與岸上控制臺(tái)聯(lián)絡(luò)。同時(shí)，使用水下廣播系統(tǒng)，每隔五分鐘通報(bào)一次，為掌握水下工作時(shí)間提供了便利�，F(xiàn)在文物發(fā)掘區(qū)域主要在一號(hào)艙和二號(hào)艙內(nèi)進(jìn)行。

　　水下繪圖工作除繼續(xù)繪制一號(hào)艙、二號(hào)艙外，還沿著基線向鐵錨方向繪制沉船平面圖, 目前已經(jīng)完成了八個(gè)艙位的平面圖。隔艙板支撐工作也是“南澳I號(hào)”考古隊(duì)的工作重點(diǎn)。經(jīng)測(cè)量，各艙位隔艙板之間間隔約80—85厘米。一號(hào)艙內(nèi)的文物發(fā)掘深度1.1米,考慮到隔艙板存在坍塌的危險(xiǎn)，考古隊(duì)利用鍍鋅管和鐵板，按照兩個(gè)隔艙板的距離，做成可調(diào)節(jié)的支撐架支撐隔艙板，以保證沉船本體的安全和完整性。

　　文物的采集工作主要針對(duì)船體基線北端和不同艙位的表層文物。為區(qū)別不同艙位的文物，特別制作了大量標(biāo)牌，由考古隊(duì)員隨身攜帶，在標(biāo)牌上標(biāo)注采集位置，并綁在存放文物的采集筐內(nèi)，便于出水后進(jìn)行文物登記。

　　為加強(qiáng)對(duì)出水文物的保護(hù)，考古隊(duì)在文物庫(kù)房安裝了溫濕儀，并由專人定期記錄庫(kù)房?jī)?nèi)環(huán)境變化情況。庫(kù)房?jī)?nèi)的部分文物也進(jìn)行了淡水脫鹽處理。另外，中國(guó)文物遺產(chǎn)院、廣東省博物館還對(duì)瓷器、鐵器、銅器、木塊等進(jìn)行取樣，用于進(jìn)行文物保護(hù)的實(shí)驗(yàn)室分析。